有氧运动减肥的原理是：通过增加身体热量消耗，促使脂肪燃烧，从而减少体内脂肪储存。有氧运动时，人体会分泌大量的激素和内分泌物质，如胰岛素、抗髓鞘性因子、生长激素、胰岛素样生长因子、胆固醇及其衍生物。它们可以帮助人体吸收更多的氧气来保证有氧代谢的正常进行。此外，它们也可以促进新陈代谢，使新陈代谢中产生的能量得到充分利用。

有氧运动减少了体内储存的一些不必要或者危害性很大的物质, 如胆固醇, 血小板, 三甘油化合物, 抗原, 抗体, 组胺, 糖原及其他一些不必要或者危害性很大物质. 这样一来，有效地减少了人体内部储存的多余或者危害性很大的物质.